中國知道網（CNKI）、萬方數據是國內最具影響力的兩大論文數據庫，分別輸入了大量的文獻。受壟斷授權的影響，數據來源和著作權維護方面競爭激烈，兩者的輸入可能覆蓋面不同。
篇大部分論文都是從CNKl和萬方輸入的。但是，也有只輸入CNKI而沒有從萬方輸入的論文。另外，某篇論文可能是從CNKl和萬方輸入的。但是，時間上有前后。因此，兩大數據庫的內容重疊在一起。因此，在同一時刻，在同一地點用AMLC和萬方論文類似性檢查系統測定同一原稿時，其測定結果不同。比如“血清游離核子……””一文中，AMLC檢查后的重量率為6.1%，萬方檢查結果為66.7%。另一本書是《FOCUS-PPDCA程序》。的應用”中AMLC檢查的重復率為40.2%，萬方為5.9%。另外，文本形式的原稿，由于檢索結果的差異很大，公式、圖表、外文的重復率的問題也無法解決。
