通常所用的常規檢驗方法為現行國家標準，或國際標準，（如FAO標準、WHO標準等），或食品進口國的標準（如美國FDA標準、日本厚生省標準、歐共體標準等）。 食品衛生微生物檢驗室接到檢驗申請單，應立即登記，填寫試驗序號，并按檢驗要求立即將樣品放在冰箱或冰盒中，積極準備條件進行檢驗。
我國開展微生物檢驗的重點食品種類為：奶制品、罐頭食品、調味品、蛋制品、淀粉類制品、發酵和非發酵性豆制品、冷凍飲品、糖果、飲用天然礦泉水等，其中食糖以及保健品的微生物檢驗為我國所獨有。
采集好的樣品應及時送到食品微生物檢驗室，一般不應超過3h，如果路程較遠，可將不需冷凍的樣品保持在1～5℃的環境中，勿使凍結，以免細菌遭受破壞。 樣品送檢時，必須認真填寫申請單，以供檢驗人員參考。
食品衛生微生物檢驗室接到檢驗申請單，應立即登記，填寫試驗序號，并按檢驗要求立即將樣品放在冰箱或冰盒中，積極準備條件進行檢驗。 一般陽性樣品發出后3d（特殊情況可適當延長）方能處理樣品；進口食品的陽性樣品，需保存6個月方能處理。
