不同查重軟件有不同的對比庫數據庫，且不同的查重軟件所能調用的數據庫數量不同。 這就是為什么同一篇論文，不同查重軟件檢測，會出現不同的查重結果，且同一個數據庫查重準確率也會不穩定。 可以說，對比數據庫越權威，數據庫涉及范圍越廣，重復率也越準確，越穩定。
知網比萬方查重的重復率相差很大。 這個大不是指知網一定比萬方查重的重復率高多少；或者是說知網一定比萬方查重的重復率低多少。 這個大是指無法根據萬方的重復率來推斷出知網的重復率多少。 因為萬方數據和知網查重是2個完全不一樣的查重軟件。
對論文重復率檢測也會得到保障，但是知網查重的費用是比較昂貴的，要是在反復修改過程中使用知網查重那對于很多學生是承擔不起，所以也不是非知網不可。 考慮到使用者大多用戶是學生，沒有自主的經濟來源， PaperPm查重軟件對注冊新用戶提供永久性【每日兩篇免費查重福利】 ，讓廣大學生感受到了什么是真正的免費論文查重系統！
再次，二者在計算規則上也存在較大差異，盡管二者都是采用切字符分割法計算重復率，但是萬方是按照連續十字以上重復計算，而知網則是按照連續十三字以上重復計算，從該計算規則上來看，似乎萬方相較于知網而言更為嚴格，實則不然，究其原因在于二者的數據庫覆蓋范圍不同，導致萬方可比對的數據較少。 最后，筆者認為，相較于 知網查重 而言，萬方查重由于其數據庫涵蓋范圍有限導致其標準過于寬泛，對于知網查重而言只具有借鑒意義，而且萬方查重不包括英文數據庫，一旦文章中涉及到英文，無法使用萬方對其進行查重。
