本文章的重點是學術查重是否包含參考文獻，學術查重參考文獻算嗎？
因而學術查重不包括格式正確的參考文獻。但最近出現非常多碩士生應屆畢業生的論文參考文獻標紅的狀態，這主要有兩個理由，首先是這些兄弟姐妹的論文參考文獻的格式不準確，格式不準確的論文參考文獻，學術論文系統是不能辨別的，只可以作論文正文來查重，有一種理由是這些碩士生應屆畢業生應用的學術論文系統并不正規的，只有正規的學術論文系統是有論文格式辨別功能效果的，出現論文參考文獻標紅的碩士生應屆畢業生就要確認我自己的論文格式是否正確，應用的學術論文系統是否正規。
綜上所述，學術查重并不包括參考文獻，學術查重一般而言只對論文的提要部分、英文提要部分、正文部分及附錄部分來查重，而參考文獻并不在學術查重范疇以內。所以，論文編者不必緊張因就要羅列眾多參考文獻在論文中。
但，只有正規的學術才能辨別參考文獻，除此之外其有的一個前置性要求是參考文獻格式正確，這也說明論文編者應該到學術不端網的“學術查重入口”等正規的學術查重網站來查重，且要按照要求編寫參考文獻，保障學術會辨別。
