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針對學術(shù)不端問題，課題組的建議之一是，在對腐敗問題保持高壓態(tài)勢的背景下，學術(shù)界對于自身的不正之風和腐敗問題，也要敢于“亮劍”，以“零容忍”態(tài)度查處各類學術(shù)不端問題。 反腐敗研究專家也建議，治理學術(shù)不端現(xiàn)象，應(yīng)在相關(guān)國家法律中寫入關(guān)于學術(shù)不端問題的條文，明確學術(shù)不端行為的認定標準和懲處辦法。
研究重點不突出。 即論文論述沒有突出研究重點，缺乏問題意識，研究問題不明確，對論文觀點缺乏提煉等。 專家評語如“缺乏嚴密的邏輯推導。 （法學）”“論證單薄，論文許多部分論證不到位，淺談輒止。 （教育學）”“論文的主要內(nèi)容缺少合理的理論框架，顯得較混亂。 （歷史學）”“文章在內(nèi)容和結(jié)構(gòu)上嚴重地偏離了自己的主題。 （文學）” 研究方法單一或不恰當。 即由于論文選用研究方法較少，實驗設(shè)計不科學，未使用該論題學科領(lǐng)域的研究方法和分析手段等原因，沒有運用正確的方法對研究對象進行客觀研究，體現(xiàn)不出作者的專業(yè)水平和研究能力，從而影響結(jié)論的有效性和可靠性。 數(shù)據(jù)不夠真實有效。 即論文所運用的數(shù)據(jù)資料的可靠性和真實性不足；數(shù)據(jù)選取不科學，甚至選取錯誤。 樣本選取的科學性不足。
作者的學術(shù)態(tài)度和學術(shù)行為的不端正，也是此次論文抽檢發(fā)現(xiàn)的較為嚴重的問題，有7%的專家評語明確提到了“學術(shù)態(tài)度不端正”或“學風不嚴謹”。 而從“不合格論文”出現(xiàn)的本質(zhì)原因而言，都可以歸結(jié)為作者學術(shù)態(tài)度的不端正和學風的不嚴謹。 而學術(shù)態(tài)度和學術(shù)行為，是決定研究和論文質(zhì)量最根本的因素。 工作量不足，即論文在撰寫過程中，作者沒有付出必要的時間和精力去完成論文的研究和撰寫工作，而是倉促寫成，敷衍了事。 存在抄襲現(xiàn)象，即抄襲他人的研究成果或直接照搬相關(guān)的文獻資料。 值得一提的是，在“不合格論文”中，有部分論文是被專家直接判定為“完全不符合要求”的論文，即無論是從選題還是研究方法、論文的撰寫等方面，都不滿足碩士論文的基本要求，這些論文無一例外都是由作者學術(shù)態(tài)度和學術(shù)行為不端正所導致的。
